Um den Frieden und die Sicherheit Japans vor den mysteriösen Riesen und Monstern zu schützen, wurde der "Shinkansen Transformierbare Roboter" von der Shinkansen Ultra Evolution Institute entwickelt. Zur Vorbereitung auf den Angriff neuer Feinde entwickelt das Ultra Evolution Institute einen neuen Roboter namens "Shinkalion Z" sowie neue bewaffnete Fahrzeuge namens "Zailiners", die sich von herkömmlichen Zügen in die "Shinkalion Z" verwandeln. Die Kinder, die die Fahrer von "Shinkalion Z" wurden, werden mit den Mitarbeitern des Instituts zusammenarbeiten, um die riesigen Monster zu bekämpfen, die wieder aufgetaucht sind. Das Auftauchen unbekannter Feinde und die Begegnung zweier Jungen.
Der Fahrer des Shinkalion Z N700S Nozomi, ein 10-jähriger Junge aus Nagoya, Präfektur Aichi....