Hunderte von Jahren nach dem 20. Jahrhundert wurden die Natur und das Ökosystem durch den Einsatz von nuklearen und biologischen Waffen zerstört. Der größte Teil der Erde ist kontaminiert und verfällt, und die große Mehrheit der Pflanzen und Tiere ist inzwischen ausgestorben. Die Welt geht zu den "Big Six", dem sechsten Massensterben. Die Menschheit baute Städte am Himmel und wanderte dort die gefährdeten Tier- und Pflanzenarten ab. Über viele Jahre haben sich die Tiere in diesen isolierten Städten entwickelt. Mit künstlicher genetischer Kreuzung erwerben sie Sprache, Zweibeinigkeit und bauen sich ein Leben und eine Zivilisation ohne Mangel auf. Niemand denkt mehr an die Welt unten. Eines Tages wandert ein einzelner Pflanzensamen in eine der Himmelsstädte, und die Kinder Kui, Hiruma und Root entdecken ihn. Unfähig, der Versuchung zu widerstehen, in die Außenwelt zu schauen, beschließen sie, ein Abenteuer nach außen zu unternehmen, ohne zu wissen, dass sie, sobald sie den Boden betreten, niemals zurückkehren können. (Quelle: MAL News)
Utopa ist eines von vier Anime Tamago 2016-Schulungsprojekten für junge Animatoren.