Während die Bewohner sich eifrig darauf vorbereiten, von der Insel zu fliehen, werden sie unerwartet von Lepka überfallen, einem Feind, von dem sie glaubten, dass er tot war. Lepka versteckt sich unter der Erde und wartet auf eine Gelegenheit, die Solarenergie von Industria zu entführen und ein Gigant zu betanken, ein Massenvernichtungsflugzeug, das er nutzen möchte, um die Welt zu übernehmen. Glücklicherweise erkennen Lana und Monsley schnell Lepkas finstere Pläne und fliehen aus Industria, um Conan und seine Gruppe zu warnen, die ein Schiff für die Evakuierung der Insel organisieren. Nach dem Erfahren der beunruhigenden Nachricht begibt sich Conan zusammen mit seinen temperamentvollen Freunden Dyce und Jimsy bereitwillig auf eine gefährliche Mission, um den bedrohlichen Giganten zu töten.
Mirai Shounen Conan: Kyodaiki Gigant no Fukkatsu ist eine bearbeitete Version der letzten drei Folgen der Fernsehserie. Der Film wurde neben Kaze no Tani no Nausicaä veröffentlicht, wurde aber vom weit verbreiteten Erfolg des Topcraft-Films überschattet.