Haruhi Fujioka, die Hauptheldin der Geschichte, ist ein intelligenter Neuling, der die angesehene und teure Ouran High School besucht. Sie schnitt ihre Haare kurz, weil ein kleiner Junge Kaugummi darin steckte, aber diese Aktion veranlasste den Host-Club, sie für einen Kerl zu halten. Im Gegensatz zu den anderen Studenten stammt sie jedoch aus einer einfachen Familie und kam durch ein Stipendium nach Ouran. An ihrem ersten Schultag zerbricht sie versehentlich eine Vase im Wert von 8 Millionen Yen, die dem Host Club gehört. Infolgedessen ist sie gezwungen, als Gastgeberin zu arbeiten, um ihre Schulden zu begleichen, und dies, indem sie sich als Junge verkleidet. Schon bald tritt sie natürlich als Gastgeberin für andere Mädchen auf und findet es sogar angenehm. Sie nimmt sich jedoch nicht gerne Zeit für das Studium und findet die Possen der anderen Gastgeber oft ärgerlich. Haruhi lebt mit ihrem Okama-Vater zusammen. Durch den Tod ihrer Mutter in jungen Jahren ist Haruhi sehr unabhängig geworden und lässt niemanden mehr um sie sorgen. Obwohl sie scheinbar unerschütterlich ist, hat sie Angst vor Gewittern.