Sie ist eine leicht verärgerte Frau, die Experimente durchführt und Menschen erschafft, die keinen körperlichen Schmerz fühlen können. Obwohl Nagisa sehr jung aussieht, wird später offenbart, dass Nagisa über 30 Jahre alt ist. Ihr Hintergrund und ihre Zugehörigkeit sind unbekannt. Sie hatte eine Schwester, aber was aus ihr geworden ist, wurde noch nicht bestätigt. Sie schuf Youji nach dem Bild ihrer jüngeren Schwester, vielleicht zur Erinnerung oder um den Schmerz in ihrem Herzen zu lindern, aber die genauen Gründe sind noch unbekannt. Ihr übertriebenes Verhalten und ihr seltsamer Lebensstil lassen sie allein und entfremdet. Sie freundet sich mit Nana an und gesteht beschämend, dass sie ihre einzige Freundin ist. Ihre Beziehung zu Ritsu ist faszinierend. Sie hat es sich zur Aufgabe gemacht, ihn zutiefst zu hassen und sich nichts anderes zu wünschen, als ihn scheitern zu sehen. Es gibt jedoch kleine Momente, die möglicherweise intimere Gefühle offenbaren, da sie tief rot wird, wenn er in ihrer Nähe ist oder sie berührt, obwohl sie standhaft bestreitet, sich um ihn zu kümmern. Sie beginnt in Band 3 und endet in Band 4 und setzt mit Ritsu darauf, dass ihr älteres Zero-Paar, Yamato und Koya, Ritsukas Soubi schlagen kann. Letztendlich sind Yamato und Koya besiegt und Nagisas Geschwisterrivalität gegenüber Ritsu geht weiter.