Seit Millionen von Jahren führt Master Megatron (einfach Megatron im Dub) fanatische Legionen böser Destrons (Decepticons) in ihrem Krieg um die Eroberung des Universums. Als lebende Waffe mit Dutzenden von selbstverschuldeten Modifikationen, die im Namen erhöhter Macht und zerstörerischer Fähigkeiten vorgenommen wurden, ist seine einzige Schwäche ein entschlossener Wunsch nach Versklavung des Universums. Sein Intellekt, sein Ego und sein Talent zur Täuschung sind unübertroffen und er regiert seine Destron-Armee mit einer Kombination aus Angst und Kraft der Persönlichkeit. Er ist entschlossen, Galaxy Convoy (Optimus Prime) und die Cybertrons (Autobots) zu schlagen und die verlorenen Planet Forces (Cyber Planet Keys) zu finden.