Agarta, die Verschlingerin der Drachen, ist dafür verantwortlich, die Dunkelheit (Serpentinendrachen) zu beseitigen, die in die Gedanken der Menschen eindringt und deren Bewusstsein korrumpiert. Dazu muss sie jedoch zuerst ihre eigenen Erinnerungen opfern. Für ihre Dienste wird sie entschädigt, indem sie Erinnerungen von vor langer Zeit erhält. Ihr einziger Begleiter ist ein Roboter namens 3-5-10, der sie bei ihrer Arbeit unterstützt und ihr Schiff wartet sowie eine Art Aufbewahrungsort ist, um ihre Erinnerungen intakt und organisiert zu halten.