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Zwei Monate nach seiner Ankunft in Tokio genießt Iku das Otaku-Leben, aber ihm passiert etwas Geheimnisvolles: Er fing an, Geister zu sehen! Ein bestimmter Geist - der nachts immer auf der Fußgängerbrücke steht - weckt sein Interesse, aber er ist fleißig ignoriert es ... Bis eines Tages der Typ mit einem Doujinshi Iku in seiner Wohnung auftaucht, der gefallen war. Er sagt, sein Name ist Seo Mimori, und da er eine verlorene Seele ist, die nirgendwo hingehen kann, wehrt sich Iku nicht wirklich, wenn er "einzieht". Aber dann wird ein schockierendes Geheimnis über Mimoris Tod enthüllt ...

23:45 besteht aus sechs Kapiteln plus einem Bonus-Extra. Es folgt eine Fortsetzung, 23:45 Re:, bestehend aus vier weiteren Kapiteln. Häufig werden sowohl das Prequel als auch die Fortsetzung als ein 11-Kapitel-Werk unter dem Titel 23:45 betrachtet.