Die Geschichte konzentriert sich auf den 16-jährigen Protagonisten Akira Kurusu, der an die Shujin High School in Tokio versetzt wurde, nachdem er von einem Mann mit politischer Verbindung wegen nicht existierender Gewalt verklagt worden war, als Akira eine Frau vor dem Missbrauch durch die rettete Mann, was zu seiner Bewährung führt. Als er in Tokio ankommt, findet er eine mysteriöse App in seinem Telefon installiert, die es ihm ermöglicht, eine andere Welt zu betreten, die aus korrupten Herzen von Erwachsenen besteht, in der er seine Kraft namens Persona erweckt. Während seiner Zeit dort kommen zwei Kommilitonen Ryuuji Sakamoto und Ann Takamaki, sowie eine formverändernde katzenartige Kreatur namens Morgana. hinzu. Die vier fühlen sich von ihrer Umgebung unterdrückt und bilden eine Gruppe, die als "Phantomdiebe des Herzens" bekannt ist, um korrupte Herzen von Erwachsenen zu stehlen und die Gesellschaft zu reformieren.
Persona 5 wird seit dem 14. Januar 2020 in englischer Sprache von VIZ Media veröffentlicht