Aufgrund der häufigen Abwesenheit ihrer Mutter sind der 11-jährige Grundschüler Minato Myoujin und seine jüngere Schwester Nagisa oft allein in ihrer Wohnung. Die einzige Gesellschaft, die die jungen Geschwister optimistisch hält, ist ihre Nachbarin Futaba Tachibana und der Welpe des örtlichen Schreins, Zarame. Auch mit der sporadischen Anwesenheit ihrer Mutter in ihrem Leben weiß Minato, dass sie immer schließlich nach Hause zurückkehrt. Nach ungewöhnlich langer Abwesenheit von zwei Wochen kehrt Minatos Mutter gerade rechtzeitig zu Nagisas Geburtstag zurück. Um den Anlass zu feiern, gehen die drei zum Vergnügungspark. Die Mutter der Geschwister lässt sie jedoch im Riesenrad zurück und geht in die regnerische Nacht, kurz bevor der Donner zwei der Wagen der Fahrt trifft. Als er wieder zu sich kommt, merkt Minato, dass er mit jemandem den Körper gewechselt hat - einem Mann, den die Polizei wegen Mordes gesucht hat! Jetzt auf der Flucht, muss Minato einen Weg finden, in seinen Körper zurückzukehren, um seine Schwester zu schützen.
Mizutamari ni Ukabu Shima wurde in englischer Sprache als Island in a Puddle von Kodansha USA vom 15. März 2022 bis 14. Februar 2023 veröffentlicht.