Als ein außerirdischer Organismus namens "Savage" die Menschheit angreift, ist die einzige Technologie, die fähig ist, den Feind zu bekämpfen, eine Waffe namens "Hundred". Ein Überlebender eines Savage-Angriffs, Hayato Kisaragi ist ein Teenager, der das höchste Kompatibilitätsniveau mit der oben genannten Technologie aufweist und als Ergebnis wird er eingeladen, seine Fähigkeiten in Little Garden zu meistern, einer prestigeträ. Im Laufe seines intensiven Trainings für den bevorstehenden Kampf zieht er sofort das Interesse mehrerer weiblicher Kollegen auf sich und gerät in eine Reihe von Vorfällen, während er versucht, gegen die Kreaturen zu kämpfen, die jetzt die Erde bewohnen und ihre Sicherheit bedrohen.