Die Serie spielt in der Tierstadt, einer Stadt, in der Tiere und Menschen in Harmonie zusammenleben. Die Zweitklässlerin Iroha Inukai ist die beste Freundin ihres Hundes Komugi. Eines Tages treffen Iroha und Komugi auf eine geheimnisvolle Kreatur namens Gargal, die in der Stadt aufgebrochen ist. Komugi verwandelt sich plötzlich in eine Pretty Cure namens Cure Wonderful, um Iroha zu schützen.