Rune Balot ist eine Prostituierte, die von Shell, einem rätselhaften Casino-Manager, der an einer Krankheit leidet, die ihn zwingt, seine Erinnerungen zu entfernen und zu speichern, fast ermordet wird. Rune ist die meiste Zeit ihres Lebens ein Opfer und steht vor einer Wahl. Während sie am Rande des Todes steht, hat sie die Möglichkeit zu leben. Es ist keine einfache Wahl für ein Opfer, aber Rune nimmt es. Ein Professor erweckt Rune als Cyborg mit der Fähigkeit, Elektronik zu steuern, wieder zum Leben und unterstützt sie mit einem selbstbewussten universellen Werkzeug namens Œufcoque. Gemeinsam beginnen sie, das Geheimnis hinter Shell, zu lüften, und Rune 'verliert die Rolle des Opfers, muss aber zwischen Gerechtigkeit und Rache kämpfen. (Quelle: Kodansha Comics USA)
Mardock Scramble basiert auf der gleichnamigen SF-Romanreihe von Tow Ubukata. Die Reihe wurde vom 23. August 2011 bis 28. Mai 2013 von Kodansha Comics USA in englischer Sprache veröffentlicht.