Nach der Katastrophe am Ende von Shin Getter Robo, wurde Hayato Jin der neue Leiter des Saotome-Forschungsinstituts und Ryoma hat sich auf dem Land zurückgezogen. Die Robotertechnologie ist so weit fortgeschritten, dass die meisten großen Länder sie besitzen, aber die Forschung von Getter Rays ist jetzt verboten und wird vor dem Rest der Welt geheim gehalten. Um den Verrückten Randou zu besiegen, dessen Basis die Arktis ist, wird ein neues Team von Getter Robo-Piloten gebildet, das eine neue Form von Getter Robo steuert, die mit einfacher Plasmaenergie betrieben wird. Der Krieg mit der Randous-Armee beginnt mit den Militärs verschiedener Nationen. Diese Serie markiert das Debüt der Shin Getter Robo.