Er ist für den größten Teil der Battle Frontier-Saga geheimnisvoll. Im Gegensatz zu den anderen Frontier Brains wird seine Silhouette während der Eröffnung nicht alleine gezeigt und ist nur in der Mitte der Gruppenaufnahme zu sehen. Trainer werden den Ort der Kampfpyramide erst herausfinden, nachdem sie die anderen sechs Symbole gesammelt haben. Dies kann bedeuten, dass Brandon höher liegt als der Rest der Frontier Brains, obwohl diese Position in den Videospielen und im Manga Anabel gehört. Als Ash in Second Times the Charm! Endlich sein sechstes Grenzsymbol erhält, erfährt er, dass es sich in der Nähe von Pewter City befindet. Sein erster Kampf mit Brandon fand im Kampf gegen den inneren Feind statt!. Zu dieser Zeit war Ash jedoch von einem alten König der Pyramide besessen, der mit Ashs Sceptile gegen Brandons Regirock kämpfte. Sceptile wurde besiegt, obwohl Ash schließlich die Kontrolle über seinen Körper wiedererlangte und die Pyramide in ein Gebiet nahe dem Indigo-Plateau verlegt wurde. Für ihre zweite Schlacht in Overjoyed!, Trat Ashs Torkoal gegen Brandons Registeel an. Torkoal wurde jedoch wie Sceptile von Brandons legendären Pokémon besiegt. Bei der Zusammenkunft der Viererbande haben Ash und Co. traf sich mit Brandon in einem Wald. In Pace - The Final Frontier! Kämpften Brandon und Ash in einem 4-gegen-4-Kampf. Brandons Dusclops besiegte Ashs Charizard in der ersten Runde, wurde dann aber von Ashs Bulbasaur besiegt. Dann trat Brandons Ninjask gegen Ashs Squirtle an, wo Squirtle Ninjask mit einer Hydropumpe schlagen konnte. In der nächsten Runde wurde Squirtle von Brandons Solrock besiegt, der wiederum gegen Bulbasaur zog. Nachdem beide Konkurrenten ihrem letzten Pokémon überlassen waren, benutzte Ash Pikachu, während Brandon dieses Mal ein weiteres Pokémon aus seiner legendären Sammlung enthüllte, ein Regice. Trotz aller Widrigkeiten gelang es Pikachu jedoch, sich gegen den legendären Golem zu behaupten, und siegte als zweites Pokémon im Anime, das nach Charizard ein legendäres Pokémon besiegt hatte. Brandon erschien erneut in A Pyramiding Rage!, Wo er den Snowpoint-Tempel erforschen wollte. Während er sich mit Ash und Freunden trifft, wird er von Paul zu einem vollen Kampf herausgefordert. Paul verliert das Match leicht, weil er die Kontrolle über seine Emotionen verliert. Brandon erwähnt später, dass sie wieder kämpfen würden, wenn Paul bereit ist. In Pillars of Friendship versucht und scheitert Brandon, Pokémon Hunter J daran zu hindern, Regigigas im Snowpoint-Tempel zu stören, der dann tobt. Es beruhigt sich schließlich, als Brandon es davor bewahrt, von J. Brandon in eine Statue verwandelt zu werden. Dann beschließt er, im Snowpoint-Tempel zu bleiben, um ihn nicht nur wieder aufzubauen, sondern auch Regirock, Regice und Registeel zu den neuen Säulen zu machen, die Regigigas schützen .